被妻子抛弃的痛苦让警察弗兰克（阿尔·帕西诺 Al Pacino 饰）陷入了痛苦的深渊无法自拔，每日，只有尼古丁与酒精才能够给予他救赎。一宗谋杀案的发生打破了城市的平静，弗兰克和搭档舍曼（约翰·古德曼 John Goodman 饰）负责此案。通过种种调查，弗兰克发现凶手是一名女子，她通过报纸上的征友启事寻找猎物，之后残忍的将他们杀害。为了追击凶手，弗兰克伪造了自己的身份在报纸上刊登了启事，一个叫做海伦（艾伦·巴金 Ellen Barkin 饰）的女人出现在了他的面前。几乎所有的证据都证明了海伦就是案件的真凶
在辛迪和弗朗索瓦家的花园里，某天地下突然长出一个圆滚滚的粉红色小球，他越长越大，最后变成了一个椭圆形的小巨人，孩子们给他起名叫巴巴爸爸。大个子给他带来了不少麻烦：人们禁止它上公共汽车，电影院还有餐厅.
故事发生在第一部的四年之后，此时特警K已经退休，成为一名普通的邮局局长，而J则继续从事MIB的工作卡洛瑟星邪恶女王蛇莲娜来到地球需找宇宙能量“萨塔之星”，占领了MIB的总部。而当年逃亡到地球的萨塔公主
