SHUFFLE第二季如果要说，根本无法说的上是第二季，只能称得上是第一季的总结，总共12话，1－11话内容完全重复，分别介绍了每个女主角的经历。第12话是番外篇，也是真正实意上的OVA了。
派系制度瓦解了，老四（提奥·詹姆斯 饰）的母亲伊芙琳（娜奥米·沃茨 饰）成为了墙内世界的统治者，她利用强悍而又严格的武装力量控制墙内居民，不允许他们越雷池一步。可偏偏翠丝（谢琳·伍德蕾 饰）和老四不信
大空明、冰上堇及新条雏姬三人组成“Luminas”，在全国进行巡回演出，第一站是日本最北端的土地“北海道”，遇见了当地偶像大地乃野及白桦丽莎两人，两人只是想’只是偶尔唱歌跳舞，让大家开心罢了”，但却也没想到，她们也将成为“星光学园”的一分子，尤于两人的加入，“偶像活动”也越来越火热了！
蓝天小镇要评选文明小镇，大部分小镇的居民逃避这件事，眯乐带着大家去看可怕的垃圾山，大家深受感触，于是团结起来好好将垃圾分类，小镇的环境更美好了。蓝天小镇的捣蛋猫发现镇子里藏着许多财富，便打起了主意，美丽的蓝天面临前所未有的环保危机，为了保护环境与资源，眯乐和他的小伙伴们，与捣蛋猫展开旷日持久且妙趣横生的对决。
